工商银行扣3元是小额账户管理费，小额账户管理费是银行针对那些日均余额低于一定数额的账户每月收取一定数额费用的账户管理费用，工商银行的收费标准是每个季度收取3元，不过是每个季度日均余额低于300元才会收取，若每个季度日均余额高于300元则不收小额账户管理费。

小额账户管理费自动从银行卡中扣除，不需要用户手动缴纳，一般建议用户将银行卡上多存几百块钱，可以应对日常需要，也可以免收小额账户管理费。