如果贷款机构只在工作日发起自动扣款，那么星期天系统不会扣款，到了下周第一个工作日，系统才会发起自动扣款。而贷款机构只根据还款日扣款，那么还款日是星期天，系统也会正常扣款，除此之外还款日为节假日，系统也会正常扣款。

大部分的贷款机构都选择为还款日扣款，因此不管还款日是休息日还是节假日，系统都会正常扣款。用户只需要确保在还款日之前，将还款资金存入银行卡中，之后系统自动扣款，就不会因为银行卡余额不足而导致扣款失败。系统自动扣款失败，可能会导致贷款逾期。

贷款自动扣款的功能可以确保用户按时还款，如果还款日当天，系统没有发起自动扣款，那么用户可以选择手动还款，手动还款成功也视为按时还款。